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10款科研软件!为你精挑细选,值得收藏!

2017-02-20 达人学社

本文分享一些日常科研中经常使用的 PC 端软件,并侧重于生物和医学相关学科。常用的必备软件,例如 MS office、Adobe 系列,在此就不提了。

1. 统计分析。

推荐 Graphpad Prism 。统计分析和作图,是科学研究里几乎每天都会进行的常规动作。虽然有高大上的R语言,也有打成包的 SAS、SPSS,或者另外一款统计作图软件 Origin,我推荐的依然是 Graphpad Prism。原因之一是分析方法的直观化,易于上手。

2. 文献管理。

文献管理应用很多,既有老牌的 Endnote,也有一些后起之秀,例如 Elsevier 收购的 Mendeley、Springer 收购的 Papers,还有 Zotero、Colwiz 等等。个人倾向于使用 Papers,理由是简洁的界面、便捷的收录和管理方式、极具亲和力的阅读界面。此外,还可以和 ios 设备进行同步。(该软件对学生有折扣,此外有免费替代品Mendeley)

3. 日常写作。

现如今,随着互联网的不断升级和智能设备的进化,静下心来写点文字几乎成为很困难的事情。如何扫除各种通信和社交工具的干扰,静心来写一篇文章?

在这里强力推荐一款 Focus Writer 。打开这个软件,我们面对的就是一张白纸。你可以尽情挥洒你的灵感,无需考虑拼写错误的单词,无需考虑蹩脚的语法,你所需要的,只是一气呵成、流畅地记录下你脑海里的所有。

4. 日程规划。

将项目进行井井有条的安排,是每个科研人员的基本素质。但是人的精力毕竟有限,这个时候我们就需要借助一些工具软件,帮我们打理事务。Mac 上有些优秀的日程规划软件,例如 omnifocus 或者 Things,但是 PC 上却鲜见优秀的此类软件。在此强烈推荐的是一款 Mylifeorganized 的软件。这款软件针对中国用户有特别的优惠,而且可以与安卓手机或者爱疯同步,不亦快哉!我们可以利用这款 app 来便捷地打理科研任务,具体使用可以单独写几篇文章。可以参考软件的帮助说明。(免费替代品:Wunderlist)

5. 词典。

国内的词典太多了,从老牌的金山词霸,到有道词典,微软的 bing 词典等,或者广告推广铺天盖地的有道词典。在这里,以本人数年在海外工作的经验,慎重向大家推荐 bing 词典或者欧路词典。它们都是免费的。尤其 bing 词典,翻译准确,读音地道;欧路词典可以加载很多扩充词典。强烈建议大家不要使用有道词典,它的缺点正好就是 bing 词典的优点。有道词典从内容到读音,纯粹就是一个经典的 Chinglish工具。

其实,汉英词典,适合于大学本科生这些初级或者中级英语水平的人群使用。作为科研人员,需要经常发表文章,或者走出国门和同行交流,所以必须熟练地撰写英文文章。对于这种人群,最好使用英英词典。因为只有借助英英词典,才能准确地理解词语的字面意思,和在具体语境中的应用,并且拿捏其准确的使用方法。为此在这里推荐一款网页端应用: dictionary.com 。你在文献里遇见不认识的单词,不要试图去汉英词典去寻找,而必须强制自己在上述的英英词典里寻找准确含义,记住例句、同义词,如果经常使用的,可以加入收藏。这款词典也有智能手机端应用。

6. 笔记。

虽然个人玩 windows 操作系统已经有差不多 17 年了,而玩 mac 不过 4 年,却总是偏见地认为,mac 上比 pc 上有更多设计优秀的软件。不过 MS office 2010(也许更早)起,微软提供了一款非常不错的笔记软件:Onenote。很多小朋友可能从来都不知道这款“隐藏”在 MS Office 套件里面的优秀笔记应用。(很多人推荐EVERNOTE, 不得不承认,这是从 mac 移植到 pc 上的优秀笔记应用之一,但是其许多特色功能需要付费才能使用。

 onenote 里面,你可以记载任何想法、规划、结果。而且可以插入图表进行编辑。无论你是执掌一个实验室、经常跑项目的 PI,还是管理实验室的 lab manager,或者一线 bench 上打拼的研究生或博士后,这款笔记应用都可以极大地提高你的工作效率。整个笔记可以打包成 pdf,还有的朋友做成 chm 或者 epub 格式,方便备案和阅读。

7. 截图

用过 Windows 的大概都知道 ctrl+printscreen 来截图,但是凭心而言,这种截图得到的图,分辨率很低。如果放到 ppt 上,很是模糊难看。Windows Vista 之后,微软推出一个新的截图工具,Snipping tool,截图的分辨率得以提高。但是我们得到截图之后,经常需要对图片作出一些修改,以进一步使用这些图片。但是 Snipping tool 明显不能满足这个要求。

在这里推荐 Faststone Capture , 这是一款小巧而功能不弱的屏幕抓图软件。可以利用鼠标或热键随意截取指定窗口、对象或区域,并能对截取图片进行编辑(包括调整大小、裁剪、注释、边缘效果等)。还可以将截取的图像直接发送到Email、FTP、Word、Excel、PPT 等。

8. 文件下载。

虽然很多人都优选选择迅雷,但是我宁愿推荐这款 Internet Download Manager 。是一款可以分线程加速下载国内外网盘资源的顶级软件。它支持的下载格式包括HTTP、HTTPS、FTP,因此平常的 IE 下载完全可以用它来代替,而且速度很快!此外,它还能够嗅探一些网页上的内容,比如下载网页内嵌的视频。当然了,它也能接管迅雷离线功能,可以满速下载。此外,它还有 IE/Firefox/Chrome 浏览器插件,方便直接点击载入下载。

9. 快速启动和搜索文件。

Mac 上有一款颇有口碑的快速启动软件叫Alfred。借鉴于此,Windows 系统现在也出现两款快速启动软件,一个叫 Launchy ,一个叫 Wox 。这个软件可以快速调动某个程序,从而让你不需要从“开始-程序”里面一个个寻找你需要启动的程序。比如输入一个“w”,它可能就能自动启动 Word,此外通过安装插件,可以搜索电脑里面的文件(可能不支持文档内容搜索)。

10. 科学图像处理软件 Image J

维基百科: Image J 是一个基于 java 的公共的图像处理软件,它是由 National Institutes of Health 开发的。可运行于 MicrosoftWindows,Mac OS,Mac OS X,Linux,和 Sharp Zaurus PDA 等多种平台。其基于 java 的特点,使得它编写的程序能以 applet 等方式分发。

Image J 能够显示,编辑,分析,处理,保存,打印 8位,16 位,32 位的图片,支持 TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS 等多种格式。ImageJ 支持图像栈功能,即在一个窗口里以多线程的形式层叠多个图像, 并行处理。只要内存允许,ImageJ能打开任意多的图像进行处理。除了基本的图像操作,比如缩放,旋转,扭曲, 平滑处理外,Image J还能进行图片的区域和像素统计,间距,角度计算,能创建柱状图和剖面图,进行傅里叶变换。

Image J 是一个开放结构的软件, 支持用户自定义插件。

和在美国某大学成像中心的中国人聊天。他说国内的学生和学者动辄就是使用盗版的PHOTOSHOP  Ilustrator。其实,借助强大的插件功能,免费的 Image J 可以帮助我们完成许多常规的图像处理和编辑任务。他建议国内的医学院校在一年级时都开设一门简易课程,让学生学会使用 image J 来处理图像。

最后一点点建议(个人观点,不喜勿喷,你没有必要接受我的观点):

1、大部分收费软件都有开源的替代版本。经济条件许可的情况下,使用正版。买不起正版,使用国外开发的免费软件来替代。尽可能避免使用国内网站提供的“破解”、“绿化”、“汉化”的软件。

2、网络防火墙和防病毒软件,必须使用正版。不要使用国内开发的”管家“、”卫士“、”助手“、”大师“等等。

3、如果你的电脑是用于工作的,不要安装淘宝支付宝、网银、qq、国产浏览器、迅雷这些要么降低工作效率、要么增加电脑感染风险的软件(想想看,正在写文章或者看文献,要么 qq 在闪烁,要么某些应用不时跳出弹窗,不烦么?)。

4、任何方面的软件,如果国外有同类软件,优先用国外软件或者英文版的软件。原因呢,比较一下 skype、firefox、qq 等等的中文版和英文版,就知道究竟了。

5、补充:浏览器和输入法。

这是大家每天都会使用的工具。个人推荐英文版 Firefox  Google Chrome,原因在于这两个浏览器都有强大的扩展功能。通过 add-ons,我们可以完成许多在 IE浏览器不能完成的任务,比如屏蔽广告。个人可以根据自己的习惯,选择合适的浏览器。我会在随后撰文,介绍一些比较实用的 add-ons。但是,养成良好的上网习惯,从远离国内浏览器开始。如果你是一个关注隐私、在意安全的上网者,不要使用搜狗、360、猎豹、maxthon、qq 这些国产浏览器。原因大家都知道的。我们不会去歧视谁,只需要一款无干扰、干干净净的浏览器,把我们的事情做好,如此而已。同理,推荐的输入法,一个是微软系统自带的输入法(已经做得很优秀了!),另外一个是谷歌拼音输入法。这些国外老牌软件开发商,重视自己的声誉,因此有足够的信心可以帮你创造一个安全的输入氛围(想必大家已经知道搜狗浏览器悄悄干的事情吧!这可不是一款小众软件。你永远不要低估国产软件的流氓底线)。

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